Ο Ανδοκίδης γεννήθηκε λίγο πριν το 440 π.Χ. και ήταν γόνος ιστορικής οικογένειας της Αθήνας. Από νέος συνδέθηκε με πολιτικούς ομίλους της πόλης, εκδηλώνοντας μετριοπαθή αριστοκρατικά φρονήματα. Παρότι η πολιτική δραστηριότητά του δεν ήταν ιδιαίτερα έντονη, κατηγορήθηκε για συμμετοχή σε σκάνδαλα, εξορίστηκε και έζησε για πολλά χρόνια στην Κύπρο, όπου απέκτησε περιουσία και συνδέθηκε φιλικά με ισχυρά πρόσωπα. Ο Ανδοκίδης έφυγε από την Αθήνα και πέθανε, άγνωστο πότε, σε ξένη χώρα.