Ο Ηράκλειτος εγεννήθη από μια αριστοκρατική οικογένεια στην Έφεσο, κατά το 544 π.Χ. Η ακμή του συμπίπτει με την 69η Ολυμπιάδα (504-501 π.Χ.). Πατέρας του ήταν ο Βλύσων (ή Βλόσων), ή Βάκτωρ, ή Ηράκων, ή Ηρακίνος / Ωρακίνος, του γένους των Ανδροκλειδών, εκείνων δηλαδή που υπό την αρχηγία του Ανδρόκλου, του υιού του βασιλέα των Αθηνών, Κόδρου, εξόρμησαν από την πόλη των Αθηνών, και έκτισαν στην Ιωνία Μικράς Ασίας την σπουδαία Έφεσο. Ο Ηράκλειτος ήταν από παιδί άξιος θαυμασμού!
